基于iTRAQ技术筛选水稻根尖甲基汞胁迫响应差异蛋白及其生物信息学分析

编号 zgly0001729284

文献类型 期刊论文

文献题名 基于iTRAQ技术筛选水稻根尖甲基汞胁迫响应差异蛋白及其生物信息学分析

作者 龙水庭  韦艳  徐晓航  刘琳  仇广乐 

作者单位 贵州医科大学公共卫生学院  中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2020,39(8)

页码 2792-2801

年份 2020 

分类号 X503.231  S511 

关键词 ITRAQ  甲基汞胁迫  差异蛋白  水稻 

文摘内容 为了解水稻(Oryza sativa L.)对甲基汞胁迫响应的分子机制,采用两优302为实验材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(i TRAQ),联合液相色谱-串联质谱技术(LCMS/MS),筛选水稻甲基汞胁迫下的根尖蛋白组差异表达蛋白,并结合生物信息学对差异蛋白进行分析。结果表明,对照组与处理组共定量了3508个蛋白质,在差异倍数(fold change)≥1.20或≤0.83,且P《0.05条件下,筛选出88个差异蛋白,其中32个蛋白表达上调,56个蛋白表达下调,其中15个差异蛋白(包括类萌发素蛋白和脂氧合酶等12个已知蛋白和3个未知蛋白)具有与金属离子结合相关属性。基因本体(gene ontology,GO)分子功能提示,差异性蛋白主要涉及催化活性、结合和转运活性等生物学过程,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析显示,差异蛋白显著富集于内质网蛋白加工、氧化磷酸化、淀粉与蔗糖代谢和苯丙素生物合成等代谢通路。研究结果为今后调控水稻中MeHg的吸收提供依据。