基于马尾松反转录转座子序列的IRAP分子标记开发及应用

编号 zgly0001527747

文献类型 期刊论文

文献题名 基于马尾松反转录转座子序列的IRAP分子标记开发及应用

作者 崔博文  范付华  丁贵杰  杨章旗  文晓鹏 

作者单位 贵州大学农业生物工程研究院生命科学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室  贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心  广西林科院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S791.248 

关键词 反转录转座子  IRAP标记  马尾松  指纹图谱  多态性 

文摘内容 [目的]为了丰富马尾松遗传信息,开发更多适用于马尾松的新型分子标记。[方法]依据马尾松Ty1-copia类型和Ty3-gypsy类型反转录转座子RT序列的保守区域设计引物,建立了马尾松IRAP-PCR技术体系并以12个基因型个体为材料进行验证。[结果]42条引物中筛选出多态性丰富、重复性好的29条进行PCR扩增,共获得227条谱带,其中多态性条带207个,多态性比例为91.19%,平均观测等位基因数(Na)为1.911 9±0.284 1,有效等位基因数(Ne)为1.468 0±0.288 2,Nei’s基因多样性指数(H)为0.291 1±0.144 9,Shannon’s信息指数(I)为0.447 2±0.195 3;利用引物P-12、P-15或R-1,可以将栽培种与无性系两类区分开;P-2可作为核心引物,能将12份供试材料有效区分开来;采用IRAP标记构建了供试种质的DNA指纹图谱;供试种质的遗传相似系数为0.46 0.69,以相似系数为基础,进行UPGMA聚类分析,以0.57为阈值可将供试种质分为三类,其中无性系内不同材料间也存在较大的遗传变异。[结论]IRAP分子标记能有效地用于马尾松种质的鉴别与亲缘关系分析等相关研究。