柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

编号 zgly0001542510

文献类型 期刊论文

文献题名 柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

作者 傅建敏  索玉静  刘慧敏  谭晓风 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  国家林业局泡桐研究开发中心  中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 柿属植物  叶绿体  密码子偏好性  最优密码子 

文摘内容 为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。