秦川牛GH基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性

编号 zgly0001390234

文献类型 期刊论文

文献题名 秦川牛GH基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性

作者 胡怡菲  昝林森  王洪宝  黄磊  钟昕  李常青 

作者单位 西北农林科技大学动物科技学院  国家肉牛改良中心 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2010年06期

年份 2010 

分类号 S823.812 

关键词 秦川牛  生长激素基因  PCR-RFLP  合并基因型 

文摘内容 【目的】研究秦川牛生长激素基因第2外显子的多态性,及其与部分体尺性状指标的相关性。【方法】以502头2周岁左右秦川牛为研究对象,利用PCR-RFLP技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与秦川牛体尺性状的关联性。【结果】在GH基因第5外显子中发现了2处SNPs,分别为错义突变和同义突变。位点1经AluⅠ酶切后产生AA、AB和BB 3种基因型,A、B等位基因频率分别为0.825 7和0.174 3;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体之间在体高、胸围、体斜长和尻长上差异显著。位点2经AflⅡ酶切后产生CC和CD 2种基因型,C和D等位基因的频率分别为0.902 4和0.097 6;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体间在腰角宽、坐骨端宽和尻长上差异显著。第5外显子2个位点合并基因型分析结果表明,双杂合基因型个体各体尺性状均显著高于其他基因型组合,并且多标记位点的组合效应高于单标记位点。【结论】组合ABCD各体尺性状数值均高于AB和CD基因型,组合ABCD可能是影响牛体尺性状的最佳基因型组合。