若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种线粒体ND4-tRNA^leu基因的序列变异和遗传多样性

编号 zgly0000562873

文献类型 期刊论文

文献题名 若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种线粒体ND4-tRNA^leu基因的序列变异和遗传多样性

作者 刘莉  郭宪光  王跃招 

作者单位 中国科学院成都生物研究所  中国科学院研究生院 

母体文献 动物学研究 

年卷期 2008,29(2)

页码 121-126

年份 2008 

分类号 Q959.62  Q951.3 

关键词 青海沙蜥红原亚种  遗传多样性  序列变异  若尔盖湿地 

文摘内容 研究了青海沙蜥红原亚种(Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis)分布于四川若尔盖辖曼(XM)、红原(HY)和甘肃玛曲(MQ)这3个地理单元7个居群的ND4-tRNA^leu基因的序列变异和遗传多样性。72个序列比对得到785bp的片断，含变异位点7个，定义了9种单倍型。结果显示7个居群总的核苷酸多样性较低(0．00231±0．00016)，单倍型多样性较高(0．806±0．024)；就单个居群而言，MQa、MQb、XMb的遗传多样性低，XMc相对较高。各居群间的Kimura双参数遗传距离小(0．001—0．005)，最大遗传距离出现在MQa和XMa之间，XM单元各居群之间遗传距离最小。但分子变异分析(AMOVA)显示3个单元间出现了显著差异(P〈0．01)，遗传变异主要存在于地理单元间，占62．61％。除MQ单元形成一支，单倍型网络图没有显示出单倍型和地理位置的对应关系，XM各居群以及HY混杂在一起。XM单元单倍型的不配对分布(Mismatch distribution)为明显左移的单峰，同时Fu’s Fs test得到负值(Fs=-2．21937)，这都暗示XM单元可能经历了近期种群扩张，这是其单倍型多样性较高和核苷酸多样性较低的原因。MQ单元遗传多样性低而与其他单元显著分化，推测与黄河在若尔盖玛曲之间贯通有关。近期沼泽的形成对XMb的隔离时间短，使得其遗传多样性低但还不足以形成大的遗传差异。