评估一种在最大似然系统发育估计中用于参数优化的连续近似计算方法的可行性

编号 zgly0001298910

文献类型 期刊论文

文献题名 评估一种在最大似然系统发育估计中用于参数优化的连续近似计算方法的可行性

作者 黄祖石 

母体文献 昆虫知识 

年卷期 2005年04期

年份 2005 

分类号 Q11 

关键词 系统发育关系  进化树  最大似然法  参数优化  近似计算方法  最大似然估计  研究者  可行性  构建方法  评估 

文摘内容 选择理由:最大似然法是一种重要的进化树构建方法。但由于运算量大,使它的应用受到限制。近似的算法可以减少最大似然法的运算量,从而加快运算速度。文章对这种近似方法的可靠性进行了评估。对于最大似然法的运用有重大影响。几乎所有的在最大似然法则下从DNA序列数据估计系统发育关系的研究都运用了一种近似的方法。一般的做法是用一个快速的方法(邻接法或简约法)得到起始的系统发育关系,然后估计它的模型参数。在进化树的搜索过程中,这些参数将是不变的,搜索也将重复进行,直到结果趋于收敛。然而,这个近似方法的有效性还没有被正式地估计过,部分地是由于估计它的有效性需要高精度的计算和全面地优化分析,而这又是比较困难的。在这