随机森林算法在β-发夹模体预测中的应用

编号 zgly0000987337

文献类型 期刊论文

文献题名 随机森林算法在β-发夹模体预测中的应用

作者 贾少春 

作者单位 忻州师范学院 

母体文献 忻州师范学院学报 

年卷期 2015(5)

页码 6-9+28

年份 2015 

关键词 随机森林算法  离散增量  矩阵打分函数  β-发夹模体 

文摘内容 基于对β-发夹模体预测的探索,文章尝试使用新的预测方法,即随机森林算法,以离散增量、矩阵打分值和预测的二级结构信息为特征参数,对Arch DB40数据库中loop长为2-8个氨基酸残基的β-发夹模体进行预测,将数据集平均分成5份,其中1份做训练集、4份做检验集,独立检验的预测精度为79.4%,相关系数为0.48。此外,对Arch DB40数据库中的β-发夹模体进行预测,在特征参数和检验方法相同的情况下,随机森林算法的预测效果要好于支持向量机(SVM)。