柑橘SCoT分子标记技术体系的建立及其在遗传分析中的应用

编号 zgly0001410044

文献类型 期刊论文

文献题名 柑橘SCoT分子标记技术体系的建立及其在遗传分析中的应用

作者 韩国辉  向素琼  汪卫星  贾志刚  洪棋斌  梁国鲁 

作者单位 西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室  中国农业科学院柑桔研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011年07期

年份 2011 

分类号 S666 

关键词 柑橘  目标起始密码子多态性(SCoT)  遗传分析  多倍体 

文摘内容 采用正交设计方法,对影响柑橘SCoT-PCR反应的Mg2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及模板DNA用量等因素进行优化,建立了适于柑橘的SCoT标记分析体系。20μL反应体系中含有:Mg2+1.5 mmol.L-1,dNTPs 0.35 mmol.L-1,引物0.625μmol.L-1,TaqDNA聚合酶0.25 U,模板DNA 10 ng。最适退火温度为49℃。利用该体系对Wan2橘橙×Li2甜橙的杂交后代及沙田柚四倍体进行分析,扩增条带清晰,扩增产物在150~2 100 bp之间。7个引物在Wan2橘橙、Li2甜橙及其18株杂交后代中共扩增出74条带,多态性条带48条,多态性比率为64.9%,在相似系数0.85处,18株杂交后代可聚为5类,表明其具有较丰富的遗传多样性;11个引物在4株沙田柚四倍体及其二倍体亲本中共扩增出84条带,其中多态性条带46条,多态性比率为54.8%,聚类分析显示5株沙田柚遗传相似系数在0.785~0.880,在相似性系数0.825处可分为3类,3株同源四倍体分别聚在不同的位置,四倍体材料均发生了不同程度的遗传变异。研究结果表明建立的柑橘SCoT体系结果稳定,重复性好,可为柑橘遗传育种提供新的技术支持。