日本落叶松EST-SSR标记开发及二代优树遗传多样性分析

编号 zgly0000750333

文献类型 期刊论文

文献题名 日本落叶松EST-SSR标记开发及二代优树遗传多样性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 杨秀艳  孙晓梅  张守攻  谢允慧  韩华 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2011,47(11)

页码 52-58

年份 2011 

分类号 S718.46 S718.54 

关键词 日本落叶松  SSR  EST-SSR  二代优树  遗传多样性 

文摘内容 利用SSR标记研究选自第1代育种试验林、拟纳入二代育种群体的264株日本落叶松二代优树的遗传变异情况。利用1620条落叶松EST序列进行EST-SSR标记的开发,共发现58条序列中含有67个SSR位点,占全部EST序列的3.58%。获得7个多态性EST-SSR标记,其中5个在朝鲜落叶松、长白落叶松、兴安落叶松和华北落叶松中均可扩增出预期目标片段,且具有多态性,表明这些标记在落叶松属内的通用性良好。利用6个EST-SSR标记和4个gSSR标记对日本落叶松二代优树群体开展遗传多样性分析,每个位点的平均等位基因数为4.6个,有效等位基因平均数为3.1个。群体观察和期望杂合度均值分别为0.5902和0.5702;Nei＇s基因多样度和Shannon多样性指数分别为0.5691和1.0966;全部单株间遗传相似系数0.1725～0.9667。说明该二代优树群体的遗传多样性较高,具有构建二代育种群体的潜力。