基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析

编号 zgly0000912829

文献类型 期刊论文

文献题名 基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘果  谢耀坚  张党权  罗建中  曾艳飞 

作者单位 国家林业局桉树研究开发中心  中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室  中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 

母体文献 桉树科技 

年卷期 2014(3)

页码 1-9

年份 2014 

关键词 桉树  叶绿体  matK基因  系统发育分析 

文摘内容 随着公共数据库信息量的不断丰富,桉树基因组序列的公布数据也逐渐增多。本文利用NCBI数据库下载的21条桉树叶绿体matK基因序列进行分析研究,发现软件构建的系统发育树树与学术界承认和使用的Hill&Johnson形态分类学状态有一定的差异,可能与下载的序列数据不够全面、覆盖的信息量不能代表该种基因组序列有关。通过对MP法、ML法、NJ法、UPGMA法和Bayes法等5种方法构建系统发育树、序列信息位点分析和形态学分类状态的比较,UPGMA法构建的系统发育树与序列的信息位点分析结果较为一致,MP法构建的系统发育树较为可信,但进一步的信息确认还需后续的研究证实。