仁用杏花芽3个发育时期转录组表达谱研究

编号 zgly0001531432

文献类型 期刊论文

文献题名 仁用杏花芽3个发育时期转录组表达谱研究

作者 宋猜  姜仲茂  李慧  乌云塔娜 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S662.2 

关键词 仁用杏  花期  转录组分析  数字基因表达谱  开花途径 

文摘内容 为给仁用杏分子育种提供理论依据,培育仁用杏晚花新品种,通过Illumina Hi SeqTM2000高通量测序——转录组测序(RNA-seq)技术,对采于花芽萌动前后3个发育时期的仁用杏花芽进行转录组测序。经组装分析获得43 469条unigenes;将所得到的unigenes与基因库数据进行比较,对unigenes进行功能注释,共22 874条unigenes获得功能注释,并预测出21 910条unigenes蛋白编码区;将3个发育时期仁用杏花芽的花转录组通过GO功能分类,将17 237条unigenes分别归类为46个GO Term;通过将所有unigenes与KOG数据库比对,共有8 379条unigenes与其它植物相似,归为26类,未知功能的unigenes有409条,预测这些基因为仁用杏的新基因;通过与KEGG数据库比对,共获得6 203条unigenes,参与259个代谢途径,其中与植物节律代谢通路相关的unigenes有33条。