青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析

编号 zgly0001533293

文献类型 期刊论文

文献题名 青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析

作者 郜银涛  周燕妮  罗朝兵  张凌云  陈坤明 

作者单位 西北农林科技大学生命科学学院  北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年10期

年份 2016 

分类号 S791.18 

关键词 青杄  类伸展蛋白  组织表达  非生物胁迫 

文摘内容 【目的】克隆青杄类伸展蛋白（extensin-like proteins,ELPs）基因PwELP1并分析该基因的表达特性,为研究ELP基因家族的功能奠定基础。【方法】以青杄cDNA文库为模板,用RACE-PCR方法克隆青杄类伸展蛋白编码基因PwELP1的cDNA全长,利用DNAMAN确定PwELP1的编码框及蛋白氨基酸的翻译,运用clustalx软件与Espript工具进行多序列比对,利用MEGA 5软件的邻位相连法构建系统树,并对编码蛋白进行生物信息学分析;利用RT-qPCR检测PwELP1基因在青杄不同组织中表达的特异性、花粉和种子不同萌发时期及幼苗受到不同逆境处理时的表达差异,分析该基因的组织发育及逆境响应表达特点。【结果】PwELP1基因全长832bp,其编码一个由159个氨基酸组成的蛋白,该蛋白的N端与C端均有比较保守的结构域;此蛋白二级结构由1个α-螺旋、5个β-折叠与3个β-转角结构构成,对其三级结构的预测印证了这一结果,同时发现该蛋白中还存在部分无规则卷曲。其分子质量为17.03ku,理论等电点为5.81。PwELP1在青杄花粉中的表达量较高,且在花粉萌发后期（3036h）以及种子萌发初期（第2天）表达量高;PwELP1的表达不同程度地受低温、高温、茉莉酸甲酯（MeJA）、H2O2、脱水以及脱落酸（ABA）等非生物逆境胁迫处理的诱导,尤其是H2O2、高温和ABA,处理初期表达量就显著升高。【结论】PwELP1在青杄花粉和种子萌发过程中可能发挥重要功能,并可参与青杄对非生物逆境胁迫的响应过程。