薄荷Eβf合成酶基因(Tspa11)的克隆、序列分析与表达特性

编号 zgly0001696913

文献类型 期刊论文

文献题名 薄荷Eβf合成酶基因(Tspa11)的克隆、序列分析与表达特性

作者 刘一钒  王丹丹  李晓红 

作者单位 辽东学院农学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S567.235 

关键词 薄荷  Eβf合成酶基因  抗蚜基因  生物信息学分析  聚类分析 

文摘内容 为克隆薄荷Eβf合成酶基因(Tspa11)、分析蛋白质结构特性与理化性质,确定其在薄荷不同组织的表达量差异,本试验以薄荷为材料,采用RT-PCR技术扩增获得Tspa11基因cDNA序列,采用生物信息学软件分析编码蛋白质的结构特性,MEGA7.0软件邻接法构建氨基酸同源性系统进化树;采用实时定量PCR技术分析Tspa11在薄荷不同组织(种子、根、茎、叶、花)的差异表达情况。结果表明,得到Tspa11基因序列长度为1 929 bp,最大开放阅读框为71～1 723 bp,共编码550个氨基酸,分子量为63.74 ku,理论等电点(pI)5.21,偏酸性;表明Eβf合成酶是一种稳定的疏水性蛋白。NCBI保守结构域在线分析表明,Eβf合成酶基因编码的氨基酸具有Isoprenoid_Biosyn_C1 Superfamily的保守结构域(E-value:1.32e-03),蛋白氨基端位于膜内;氨基酸同源性分析,夏枯草Eβf合成酶基因与薄荷Tspa11亲缘关系最近,构成了一个小分支,同源性高达90%;夏枯草Tspa11基因在同条件下种子的基因表达量极显著地高于其他组织(P<0.01),根部表达量最低。