南瓜生长素响应因子(ARF)基因家族的全基因组分析及表达分析

编号 zgly0001723851

文献类型 期刊论文

文献题名 南瓜生长素响应因子(ARF)基因家族的全基因组分析及表达分析

作者 袁敬平  申长卫  陈碧华  李新峥 

作者单位 河南科技学院园艺园林学院  河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心  河南科技学院资源与环境学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年11期

年份 2020 

分类号 S642.1 

关键词 南瓜  生长素响应因子  基因复制  顺式作用元件 

文摘内容 为研究南瓜(Cucurbita moschata)生长素响应因子(ARF)基因家族,利用生物信息学工具分析南瓜ARF(CmARF)基因数目、在染色体上的分布、结构以及编码蛋白保守结构、基序、顺式作用元件,并利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析CmARF的组织表达模式。共鉴定出32个CmARF成员,根据其氨基酸序列的一致性将其分为7个亚族(Ⅰ～Ⅶ),同一亚族的ARF通常表现出相似的基因结构(外显子-内含子分布)和保守结构域。染色体定位分析表明, 32个CmARF在21条染色体中的15条存在不均匀分布;其中16个CmARF形成8个重复的基因对,且都经历了片段复制事件。CmARF在根、茎、子叶和真叶中的表达特征表明,其具有组织特异性。顺式作用元件分析表明,一些关键CmARF可能参与对脱落酸、茉莉酸甲酯、生长素、水杨酸等的响应。所有CmARF均含有保守的DBD和MR结构域,部分CmARF还含有CTD结构域。CmARF基因的结构与进化时间相关,且CmARF的扩张是由于基因的片段复制事件造成的。本研究为阐明CmARF的功能和作用机理提供理论基础。