拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析

编号 zgly0001630858

文献类型 期刊论文

文献题名 拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析

作者 薛皓月  徐桂霞  国春策  山红艳  孔宏智 

作者单位 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室  中国科学院研究生院 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2010年02期

年份 2010 

分类号 Q943.2 

关键词 Arabidopsisthaliana  A.lyrata  MADS-box基因  拷贝数变化  进化速率 

文摘内容 MADS-box基因编码一类转录因子。在被子植物中,MADS-box基因对于营养生长和生殖发育都有重要的调控作用,是植物体(特别是花序、花和果实)的正常发育所不可或缺的。为了理解近缘物种在遗传基础上的异同,我们对拟南芥(Arabidopsis thaliana)和琴叶拟南芥(A.lyrata)基因组中MADS-box基因的拷贝数目和进化式样进行了比较分析。通过搜索公共数据库,我们在拟南芥和琴叶拟南芥中分别鉴定出了106和115个基因。系统发育分析的结果表明,这些基因属于I型和II型MADS-box基因。在两个物种分化之后,II型基因的拷贝数目变化不大,I型基因则经历了多次独立的基因丢失和获得事件。通过比较这些基因在染色体上的排列,我们不但鉴定出了存在微共线性的基因组区段,而且发现新基因产生的主要机制是串联重复和散在重复。分子进化的研究进一步表明,I型和II型基因在进化式样上存在着显著差异:II型基因在进化中一般都受到了较强的选择压力,而I型基因大多受到的选择压力较弱。本研究将为深入理解近缘物种在基因和基因组层面上的异同、探讨物种分化和生物多样性形成的机制等问题提供新思路。