基于SSR和SRAP标记的红花玉兰品种遗传关系分析及分子鉴定

编号 zgly0001678564

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR和SRAP标记的红花玉兰品种遗传关系分析及分子鉴定

作者 张妹  何正权  马江  桑子阳  朱仲龙  张德春  马履一  陈发菊 

作者单位 三峡区域植物遗传与种质创新重点实验室(三峡大学)湖北省三峡特色植物繁育工程技术研究中心三峡大学生物技术研究中心  北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室  湖北五峰土家族自治县林业科学研究所  五峰博翎红花玉兰科技发展有限公司 

母体文献 北京林业大学学报 

年卷期 2019年09期

年份 2019 

分类号 S685.15 

关键词 红花玉兰  遗传多样性  品种鉴定  SSR分子标记  SRAP分子标记 

文摘内容 【目的】为了解析红花玉兰各品种间的遗传多样性和遗传差异等问题,本研究采用SSR和SRAP分子标记方法对红花玉兰不同品种的遗传多样性水平和遗传分化程度进行评估,以建立其分子标记体系。【方法】以35个红花玉兰品种为实验材料,分别进行SSR和SRAP标记扩增,计算出SSR和SRAP分子标记的各遗传参数。利用NTSYS-pc2.1软件计算各品种间的遗传相似系数并用非加权法(UPGMA)进行聚类分析。通过R语言分析筛选出能够完全区分红花玉兰品种的引物对组合。【结果】经筛选共获得18对具有多态性且条带清晰的SSR引物,分别以35个红花玉兰品种基因组DNA为模板,共扩增出DNA条带128条,每对引物扩增条带在2～15之间,平均每对引物扩增7.1条,平均带型数为10.6,平均有效带型数为5.4,平均分辨能力(D)为0.72;不同引物的多态性位点百分比变化范围很大,在0.142 9～1.000 0之间,均值为0.730 2;Shannon’s指数平均为0.304 2,范围是0.086 4～0.433 7;平均期望杂合度为0.248 8,范围是0.059 2～0.282 3。利用筛选获得的11对SRAP引物对35个红花玉兰品种进行鉴定,共扩增156条DNA条带,引物扩增条带数在7～18之间,平均每对引物扩增14.2条,平均带型数为22.7,平均有效带型数为13.2,平均分辨能力(D)为0.93;11对引物的多态性位点百分比平均数为0.815 6,变异范围是0.657 1～1.000 0;平均Shannon’s指数为0.375 9,变异区间在0.287 2～0.455 3;平均期望杂合度为0.240 4,范围在0.180 2～0.311 6之间。【结论】红花玉兰具有较高的遗传多样性,经筛选和优化后的SSR和SRAP引物组合均能将现有红花玉兰品种完全区分开,实现了对红花玉兰品种的简便、快速、准确地鉴定,并为红花玉兰的保护和繁育,以及新品种的选育提供了重要的参考。