草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo 1的序列分析及其表达规律

编号 zgly0001495690

文献类型 期刊论文

文献题名 草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo 1的序列分析及其表达规律

作者 陶永新  黄千慧  陈仁良  谢斌  连玲丹  张磊  丁宇斯  江玉姬  谢宝贵 

作者单位 福建农林大学园艺学院  福建农林大学生命科学学院菌物研究中心  福建农林大学食品科学学院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 S646.13 

关键词 草菇  多糖单加氧酶基因  定量PCR  表达量 

文摘内容 依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律。结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1432bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside hydrolase family 61(GH61)结构域和C端的cellulose-binding domain(CBD)结构域。通过对葡萄糖、无碳源(饥饿诱导)、微晶纤维素、滤纸、稻草和木屑6种不同基质诱导草菇菌丝的定量PCR,结果筛选出稻草对Vv-lpmo1基因有最强的诱导作用。进一步研究稻草诱导不同时间的变化过程中,该基因的表达规律为0~4h先下调;4~12h恢复到初始水平;12h以后开始迅速上调并维持较高水平。本研究表明草菇多糖单加氧酶基因Vv lpmo1属于诱导表达型基因,可能在草菇降解稻草基质中起着重要作用。