基于线粒体Cyt b基因的全长序列探讨闭壳龟类的系统进化

编号 zgly0000705500

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体Cyt b基因的全长序列探讨闭壳龟类的系统进化

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张艳云  毕婷婷  宋娇莲  张莉  蒲友光  聂刘旺 

作者单位 安徽师范大学生命科学学院 

母体文献 生物学杂志 

年卷期 2011,28(1)

页码 22-26,45

年份 2011 

分类号 Q959.63 

关键词 闭壳龟  淡水龟科  Cytb基因  系统发育 

文摘内容 采用PCR技术对淡水龟科具闭壳结构的黄缘盒龟、黄额盒龟、金头闭壳龟、潘氏闭壳龟、锯缘龟和白腹摄龟的线粒体Cytb基因的全长序列进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中16种淡水龟科物种的同源序列,进行了序列变异和系统发生分析。经C lustalX1.8软件对位排列后共有1154个位点,其中可变位点413个,简约信息位点301个;A+T的平均含量(56.5%)高于G+C(43.5%)。在氨基酸密码子中,第一位富含A,第二位富含T,第三位富含C;碱基转换/颠换率为5.97,碱基替换多发生在密码子第三位。以中华鳖和马来鳖为外群,通过最大简约法,最大似然法和贝叶斯法重建了分子系统树,均具有一致的拓扑结构,结果表明: 金头闭壳龟和潘氏闭壳龟最先聚成一支,再和三线闭壳龟聚成一组,说明形态上相似的三种闭壳龟亲缘关系最近;闭壳龟属、盒龟属和单种锯缘龟属聚成一个单系的闭壳龟群,建议合并为闭壳龟属;齿缘龟属和果龟属聚为一支,它们与新的闭壳龟属关系较远,揭示闭壳结构的形成不是由一个共同祖先分化而来;乌龟属、花龟属和拟水龟属三属为并系起源,建议三属可以合并为一属。