微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用

编号 zgly0001370936

文献类型 期刊论文

文献题名 微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用

作者 何小燕  白俊杰  刘小林  樊佳佳  何小平  李胜杰  叶星 

作者单位 西北农林科技大学动物科技学院  中国水产科学研究院珠江水产研究所  热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室  中国水产科学研究院珠江水产研究所热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室  大连水产学院生命科学与技术学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2009年08期

年份 2009 

分类号 S917.4 

关键词 微卫星  大口黑鲈(Micropterussalmodies)  亲权分析  聚类分析 

文摘内容 【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。【结果】所选的12个微卫星DNA多态位点在102个子代中的平均等位基因数(A)为3,平均观测杂合度(Ho)为0.594 8,平均期望杂合度(He)为0.545 7,平均多态信息含量(PIC)为0.475 9。Cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上。从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星DNA位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体。亲权分析结果与聚类分析结果一致。【结论】所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。