基因芯片技术研究柽柳NaHCO3胁迫下基因的表达

编号 zgly0000363866

文献类型 期刊论文

文献题名 基因芯片技术研究柽柳NaHCO3胁迫下基因的表达

学科分类 220.1050;树木生理学

作者 杨传平  王玉成  刘桂丰  姜静  张国栋 

作者单位 东北林业大学林学院 

母体文献 生物工程学报 

年卷期 2005,21(2)

页码 220-226

年份 2005 

分类号 Q945  S793.5 

关键词 基因表达谱  基因芯片技术  未知基因  对照  信号传导  上调  比值  柽柳  盐胁迫  杂交 

文摘内容 运用基因芯片技术研究了NaHCO3胁迫下柽柳(Tamarix androssowii)基因的表达.将Cy5和Cy3两种荧光染料分别标记在NaHCO3处理和对照的柽柳cDNA上,将两种荧光探针混合,与载有柽柳基因的高密度芯片进行杂交并用芯片扫描系统进行扫描,通过Cy5与Cy3信号强度比值的计算研究基因的差异表达.共获得了89个差异表达的基因,其中,27个下调表达,62个上调表达.BlastX分析表明这些基因按功能可以分为光合作用、活性氧清除、渗透调节、信号传导与表达调控、代谢、发育相关、核糖体蛋白、蛋白质的分解与再生、转运类蛋白、水通道蛋白等几大类别.同时,发现了一些与盐胁迫相关的功能未知基因或未有任何功能信息的基因,这些基因可能在柽柳抗盐过程中具有重要作用.揭示了柽柳的抗盐胁迫涉及的几种重要途径,并获得了NaHCO3胁迫前后柽柳基因表达谱。