基于毒性相关基因序列的稻瘟病菌群体遗传多样性分析

编号 zgly0001514189

文献类型 期刊论文

文献题名 基于毒性相关基因序列的稻瘟病菌群体遗传多样性分析

作者 邓其明  颜学海  何建美  邓元宝  韩冬  杨阳  李彬  朱军  李平 

作者单位 四川农业大学水稻研究所 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 S435.111.41 

关键词 稻瘟病菌  致病基因  无毒基因  DNA指纹  遗传多样性 

文摘内容 选用16对毒性相关基因特异性引物对四川和重庆9个县(市)分离到的200个稻瘟病菌单孢菌株进行PCR扩增,并采用最长距离法进行聚类分析,结果显示各引物均能扩增出其目的条带,多态位点百分率(P)高达93.75%,扩增频率差异较大;200个菌株可归为70个不同的单元型,其中单元型SCH13为优势单元型;在0.86遗传相似水平上,200个菌株可划分为27个遗传宗谱,包括1个优势宗谱,3个亚优势宗谱,14个次要宗谱,9个小宗谱,层次丰富;在群体平均水平上,病菌群体具有丰富的遗传多样性(H=0.324 4,I=0.484 2),且群体间差异较大;9个种群在遗传距离为0.05水平上可分为4个类群,种群遗传谱系与地理区域分布呈一定相关性。同时,该地区的群体存在一定的遗传分化(HT=0.320 0),群体内多样性大于群体间多样性(Hs=0.179 6,Dst=0.140 4),总遗传变异的56.13%存在于群体内(Gst=0.438 7),群体间基因流动性较小(Nm=0.639 6)。本研究揭示了四川和重庆部分区域稻瘟病菌群体遗传结构、遗传多样性及其与地理分布之间的关系,为抗病育种和品种布局奠定了基础。