马尾松生长性状显著关联标记PCZ090所在基因的挖掘与生物信息学分析

编号 zgly0001739141

文献类型 期刊论文

文献题名 马尾松生长性状显著关联标记PCZ090所在基因的挖掘与生物信息学分析

作者 罗群凤  吴志铭  冯源恒  龚桂芳  杨章旗 

作者单位 广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室广西马尾松工程技术研究中心 

母体文献 广西林业科学 

年卷期 2022,51(2)

页码 184-189

年份 2022 

分类号 S791.248 

关键词 基因组关联分析  SSR  生长性状  马尾松  谷胱甘肽S-转移酶 

文摘内容 马尾松(Pinus massoniana)是我国南方重要的用材树种。基于马尾松生长性状候选基因组关联分析,得到显著关联的SSR标记位点PCZ090,通过生物信息学分析方法挖掘其所在基因的全长序列及生理功能。结果表明,基因全长1636 bp,包含1个795 bp的开放阅读框,编码264个氨基酸,蛋白质分子量为30.88 kDa,理论等电点为9.27;参与谷胱甘肽代谢过程,具有谷胱甘肽转移酶活性。通过NCBI CDD进一步确定PCZ090所在基因是谷胱甘肽S-转移酶家族蛋白成员,命名为PmGSTTCHQD1,根据同源基因的注释结果,推测该基因可能参与了催化氯代异源物质的代谢过程,在细胞解毒机制中具有重要作用。该研究结果对于解析细胞解毒能力对马尾松生长的影响具有重要的参考价值。