杆状病毒p35基因序列与分子进化

编号 zgly0001316012

文献类型 期刊论文

文献题名 杆状病毒p35基因序列与分子进化

作者 黄宇琳  曹广力  薛仁宇  贡成良 

作者单位 苏州大学生命科学学院  苏州大学生命科学学院 215123  215123 

母体文献 中国蚕业 

年卷期 2006年03期

年份 2006 

分类号 Q939.4  S476.13 

关键词 杆状病毒  p35基因  分子进化  苜蓿银纹夜蛾  核多角体病毒  核苷酸序列  系统进化分析  Neighbor  斜纹夜蛾  夜蛾科 

文摘内容 本文对家蚕核多角体病毒(BomoNPV)、苜蓿银纹夜蛾核多角病毒(AucaNPV)、斜纹夜蛾核型多角体病毒(SpliNPV)、粘虫核型多角体病毒(LeseNPV)、美国白蛾核型多角体病毒(HycuNPV)和薄荷灰夜蛾核型多角体病毒(RaouNPV)6类杆状病毒的p35基因进行序列比对和进化分析。结果显示,LeseNPV、AucaNPV、SpliNPV、RaouNPV、BomoNPVp35基因核苷酸序列之间同源性在78%￣100%之间,氨基酸间的同源性在58%￣100%之间,总体上p35基因在进化上具有保守性;Chou-Fasman法对蛋白2级结构的预测结果显示,不同杆状病毒P35蛋白的2级结构在总体上具相似性,但在某些区域显示明显的差异,这种差异也许是导致P35抗凋亡活性不同的原因。Neighbor-Joining算法建立了基于p35基因的分子进化系统树,结果显示:LeseNPV处于无根树的最根部,与其它NPV相距较远,AucaNPV、SpliNPV、RaoumuNPV各自形成独立的分枝,BomoNPV与HycuNPV形成独立的1组;12种不同来源的BomoNPVp35基因的系统进化分析显示,BomoNPV基本上按采集地聚类。