平榛AGAMOUS基因的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0000759988

文献类型 期刊论文

文献题名 平榛AGAMOUS基因的克隆与生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 陈新  王贵禧  梁丽松  马庆华 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 

母体文献 生物技术通报 

年卷期 2011(11)

页码 207-211

年份 2011 

分类号 Q811.4 

关键词 平榛  基因克隆  生物信息学 

文摘内容 以野生平榛(Corylus heterophylla Fischer)为试材,采用RT-PCR方法从花芽中获得了一个平榛AGAMOUS基因cDNA,命名为ChAG,GenBank登录号为JN828811。序列分析结果表明,ChAG基因编码一个长度为726 bp,编码241个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列分析显示,该基因属于MADS家族AG亚家族。序列比对和系统进化分析表明,ChAG基因与欧榛的亲缘关系最近,相似性达99%。采用生物信息学手段对ChAG基因的保守结构域、疏水性和二级结构等进行分析。