基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达

编号 zgly0001709636

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达

作者 何晨晨  刘俐君  鲁晓燕 

作者单位 石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年07期

年份 2020 

分类号 S661.1 

关键词 新疆野苹果  NaCl胁迫  转录组测序  糖酵解 

文摘内容 【目的】筛选新疆野苹果响应NaCl胁迫相关基因。【方法】以新疆野苹果组培苗为试验材料,对150 mmol·L-处理48 h后的新疆野苹果幼苗叶片及根系进行转录组测序。【结果】与对照相比,NaCl处理48 h时,新疆野苹果幼苗叶片中差异表达基因为3 364个,其中1 745个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,1 619个DEGs下调表达;根系中差异表达基因为3 808个,其中1 057个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,2 751个DEGs下调表达。新疆野苹果叶片和根系中所共有的差异基因有2 095个得到注释,这些基因共涉及44个Pathway,富集最显著的Pathway主要有糖酵解/糖异生、磷酸戊糖途径、果糖和甘露糖代谢、丙酮酸代谢等。【结论】通过转录组测序和qRT-PCR验证发现,新疆野苹果受到NaCl胁迫后,在糖酵解过程中TPI、FBPase、pckA、PPDK等基因表达量发生明显变化,说明糖酵解途径在新疆野苹果应答NaCl胁迫过程中起着一定的作用。