利用DGE对黄肉猕猴桃果实着色过程中相关差异基因表达的解析

编号 zgly0001444099

文献类型 期刊论文

文献题名 利用DGE对黄肉猕猴桃果实着色过程中相关差异基因表达的解析

作者 高洁  黄春辉  葛翠莲  曲雪艳  辜青青  徐小彪 

作者单位 江西农业大学农学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 S663.4 

关键词 ‘金丰’猕猴桃  黄肉  数字基因表达谱  差异表达基因 

文摘内容 【目的】构建数字基因表达谱(DGE),寻找调控黄肉猕猴桃果实呈色的潜在关键基因。【方法】以中华猕猴桃(Actinidia chinensis Planch)黄肉品种‘金丰’为试材,利用Illimina/Hisseq测序技术构建其果实发育中3个不同转色期DGE文库,以转录组数据为参考数据库,进行GO功能富集以及Pathway功能富集分析。【结果】结果表明,DGE文库构建转色前期、转色期和成熟期分别获得4 724 009,4 565 159和4 626 730个标签。转色期与转色前期之间差异表达基因的个数为2 641个,成熟期与转色前期有差异表达的基因个数是2 671,成熟期与转色期之间有1457个基因有表达差异。通过GO功能富集及Pathway功能富集分析,分别获得了102条叶绿素Unigenes与111条类胡萝卜素Unigenes,其中12条叶绿素Unigenes及14条类胡萝卜素Unigenes在果实的3个不同转色期有显著差异表达(P<0.05)。【结论】黄肉猕猴桃呈色的关键基因可能存在于具有显著差异表达的12条调控叶绿素合成以及14条调控类胡萝卜素合成的Unigenes之中。