西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

编号 zgly0001459576

文献类型 期刊论文

文献题名 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

作者 吴月燕  陶巧静  李波  许丹叶 

作者单位 浙江万里学院生物与环境学院  浙江大学农业与生物技术学院 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 Q946  S685.21 

关键词 植物学  西洋杜鹃  遗传多样性  SRAP-PCR  正交设计  体系优化  聚类分析 

文摘内容 以西洋杜鹃Rhododendron hybridum功能叶片为试验材料,采用改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取西洋杜鹃基因组DNA,并且运用L16(44)正交试验设计,在4个水平上对影响西洋杜鹃相关序列扩增多态性(SRAP)反应的镁离子(Mg2+)浓度、Taq酶用量、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs)浓度、引物浓度等4个因素进行了优化,确立了一套适用于西洋杜鹃的稳定可靠、重复性强的SRAP-PCR反应体系。实验发现,其最佳反应体系(20.0μL)为:Mg2+浓度1.750 mmol·L-1,dNTPs浓度0.175 mmol·L-1,Taq酶1.500×16.67 nkat,引物0.200μmol·L-1。利用该优化体系对24个西洋杜鹃花品种进行遗传多样性分析。从88对SRAP引物中筛选出10对扩增清晰且多态性高的引物,共扩增出217条带,其中多态性条带212条,多态性比率达97.35%。24个杜鹃品种的遗传相似系数变化范围为0.591~0.708,算术平均数的非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果显示:在相似系数为0.590处将24个供试品种分为2个类群,在相似系数为0.623处又可分为2个亚群,说明该优化体系可应用于西洋杜鹃花品种鉴定及遗传多样性的研究。