草莓FaCOP1的克隆及其表达特异性分析

编号 zgly0001540225

文献类型 期刊论文

文献题名 草莓FaCOP1的克隆及其表达特异性分析

作者 张云婷  江雷雨  叶云天  冯琛  孙勃  王小蓉  汤浩茹 

作者单位 四川农业大学园艺学院  四川农业大学果蔬研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S668.4 

关键词 草莓  FaCOP1  生物信息学分析  表达特异性  光质  光形态建成 

文摘内容 为探索草莓光形态建成抑制子FaCOP1的功能及其表达特异性,采用同源克隆法获得‘丰香’草莓FaCOP1的完整开放阅读框序列,对该序列及其编码的氨基酸序列进行相关生物信息学分析,同时采用qRT-PCR分析该基因的时空表达以及在不同光质处理下的表达模式。结果表明,FaCOP1开放阅读框全长1 989 bp,Gen Bank登录号为KX583676,编码662个氨基酸,蛋白质分子量为74.7187 kD,理论等电点为6.54,具有环形锌指域,卷曲螺旋域和WD40重复序列等3个保守结构域。序列比对以及系统进化树分析发现,COP1进化过程中具有高度保守性以及物种间的差异性。qRT-PCR结果表明,FaCOP1在草莓的根、茎、叶、花及成熟果实中均有表达,花中的表达量最高,其次是叶和根,而茎和成熟果实中最少。随着草莓果实的发育(从小绿期到全红期)FaCOP1的转录水平总体呈现递减的规律,与果实花青素积累模式相反。草莓叶片和果实的FaCOP1表达均能够被白、红、蓝及红蓝光(1︰1)诱导。FaCOP1在转录水平上没有阻遏FaHY5的表达,其关系需在蛋白质水平上进一步验证。