基于EST库的枳APETALA2基因cDNA克隆及其表达分析

编号 zgly0001371022

文献类型 期刊论文

文献题名 基于EST库的枳APETALA2基因cDNA克隆及其表达分析

作者 宋长年  房经贵  王晨  上官凌飞  章镇 

作者单位 南京农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2009年06期

年份 2009 

分类号 S666 

关键词 柑橘  枳  花器官发育  基因  表达分析 

文摘内容 根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以拟南芥APETALA2 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,克隆了柑橘APETALA2基因的cDNA序列,并以枳[Ponci-rustri foliata(L.)Raf.]花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异引物,利用RACE技术分别获得该基因的5′和3′末端,序列拼接后获得枳的APETALA2 cDNA全长。该cDNA全长为1980bp,命名为Pt-AP2。Pt-AP2核苷酸序列有一个1539bp完整的开放读码框(ORF),5′末端起始密码子ATG其始于290bp,3′末端非翻译区为152bp,其中含有27bp的Ploy+(A)。该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EU883665。推导该cDNA编码512个氨基酸,与苹果、矮牵牛和拟南芥中相应序列同源性分别为59.1%、59.7%和63.8%。序列分析表明,Pt-AP2除了具备完全保守的核定位信号序列(KKSR)外,还具有两个高度保守的重复序列即AP2结构域。分别采用半定量RT-PCR和SYBR GreenI实时定量RT-PCR方法分析Pt-AP2在枳叶、茎、根、花和果等不同器官中的表达水平,结果一致表明Pt-AP2在各个器官中的表达水平不同,花中的表达量最高,果实中的表达量最低。