桂花SCoT标记体系的建立及其在遗传多样性分析中的应用

编号 zgly0001485343

文献类型 期刊论文

文献题名 桂花SCoT标记体系的建立及其在遗传多样性分析中的应用

作者 袁王俊  马寅峰  董美芳  韩远记  张维瑞  尚富德 

作者单位 河南大学生命科学学院  河南大学中药研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年03期

年份 2015 

分类号 S685.13 

关键词 桂花  SCoT分子标记  退火温度  遗传分析 

文摘内容 以‘籽银桂’桂花叶片DNA为材料,以2×EsTaq Master Mix预混液为基本体系,针对影响SCoT-PCR反应的退火温度、模板DNA用量、引物浓度等因素进行优化,建立了适于桂花SCoT分子标记的反应体系。12μL反应体系含有30ng模板DNA,引物浓度为0.4μmol·L-1,不同的引物退火温度分别为48、49.9、54.3或56℃。利用该体系对12个桂花品种进行分析,扩增条带清晰,扩增产物在1502200bp之间。12条引物共扩增出244条带,其中多态性条带238条,多态性比率为97.47%。在相似系数0.57水平处,‘九龙桂’形成第Ⅰ组,其余11个品种形成第Ⅱ组。第Ⅱ组中‘柳叶桂’、‘香云’、‘早籽黄’、‘大花金桂’、‘桂冠籽金桂’、‘鹅黄’、‘籽金桂’和‘醉云’8个花色不完全相同的品种聚在一起;‘金桂’、‘早银桂’和‘籽银桂’3个不同花色的品种聚在一起,说明品种间的亲缘关系与花色不完全相关,这与其它分子标记结果一致。