四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用

编号 zgly0000475751

文献类型 期刊论文

文献题名 四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用

作者 杨俊波  李洪涛  杨世雄  李德铢  杨莹燕 

作者单位 中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室  中国科学院研究生院 

母体文献 云南植物研究 

年卷期 2006,28(2)

页码 108-114

年份 2006 

分类号 Q946  Q949 

关键词 山茶属  DNA序列  进化速率  分子系统学 

文摘内容 选取山茶属14个组中的10组21种植物对目前常用于属内种间的4个DNA片段(ITS、waxy、trnL-F、rpL16)进行序列测定。结果表明: (1)来自叶绿体基因组的2个片段(trnL-F、rpL16)其PCR扩增和测序都很容易, 但两者的进化速率都非常慢, 序列矩阵只有很少信息位点(trnL-F含9个, rpL16为20个), 不能提供必要的系统发育信息。(2)来自核基因组的ITS片段其PCR产物比较容易获得, 但其序列的测定存在较多问题。(3)waxy是来自核基因组的另一个片段, 其PCR扩增因受模板DNA的数量和质量的影响很大而有一定难度, 但其进化速率较快, 序列矩阵具有较多信息位点(92个), 并且在山茶属是单拷贝, 这对于解决山茶属这类具有许多近缘物种的类群的系统关系有重要价值。基于tsnL-F、rpL16和waxy三组数据所建分子系统树支持山茶属为一单系, 但属下系统由于取样等原因有待进一步研究。