基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化

编号 zgly0000703257

文献类型 期刊论文

文献题名 基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 马春艳  马凌波  倪勇  沈盎绿  张永  张凤英  赵云龙 

作者单位 华东师范大学生命科学学院  中国水产科学研究院东海水产研究所 

母体文献 中国水产科学 

年卷期 2010,17(3)

页码 471-477

年份 2010 

分类号 Q959 

关键词 线粒体DNA  16SrRNA  棱鳀属  系统进化 

文摘内容 对6种棱鳀属(ThryssaCuvier1829)鱼类共21个个体的16SrRNA基因进行PCR扩增,经比对校正得到572bp的基因片段,共检测到8个单倍型,棱鳀属6个种所有单倍型之间共存在8个插入/缺失;此外有99个变异位点,其中简约信息位点87个;多态位点比例为17.3%;序列中转换多于颠换,转换/颠换之比为1.6;A+T含量(53.6%)明显高于C+G含量(46.4%),序列表现出明显的T偏倚。基于Kimura双参数法,计算的种间遗传距离介于0.4%[黄吻棱鳀(T.vitrirostris)与中颌棱鳀(T.mystax)]到11.33%[黄吻棱鳀与赤鼻棱鳀(T.kammalensis)]之间。以日本鳀(Engraulis japonius)和欧洲鳀(Engraulisencrasicholus)为外群构建的NJ树和ML树中,赤鼻棱鳀位于进化树的基部,是最早分化出来的种;进化树显示,黄吻棱鳀和中颌棱鳀关系最近。本研究结果支持形态学得出的赤鼻棱鳀最先分化的结论,认为中颌棱鳀和黄吻棱鳀可能为同一个种,至于汉氏棱鳀(T.hamiltonii)和杜氏棱鳀(T.dussumieri)的分类地位有待进一步确认。