刺槐Na^＋／H^＋逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析

编号 zgly0000517817

文献类型 期刊论文

文献题名 刺槐Na^＋／H^＋逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析

学科分类 220.1060;森林生态学

作者 于学宁  刘欣玲  董秀春  樊金会  曹帮华 

作者单位 山东农业大学林学院  山东艺术学院校园管理中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2007,5(6)

页码 775-784

年份 2007 

分类号 Q948.113 

关键词 Na^＋／H^＋逆向转运蛋白基因  盐胁迫  生物信息学分析  刺槐 

文摘内容 盐分胁迫严重影响植物生长和产量。为了研究木本植物对盐分的适应性，利用5＇RACE技术，从刺槐中克隆得到液泡Na^＋／H^＋逆向转运蛋白基因RpNHX1。该基因长度为2281bp，含有一个开放阅读框，编码535氨基酸残基组成的蛋白，该蛋白序列与大豆GmNHX1和拟南芥AtNHX1相似，氨基酸的同源性分别达85％和69％，RpNHX1属于NHX亚族的NHX-I分枝。用生物信息学的方法预测RpNHX1具有所有Na^＋／H^＋逆向转运蛋白共同的结构特点，即含有疏水的N末端，10个跨膜螺旋区域和一个具有调节功能的C端亲水区域，其中氨氯吡嗪咪敏感基序和CaM结合域也是保守的。在4和5的螺旋区域之间，存在有一串带负电荷氨基酸，显示出有规律的排列模式，这些模式在生物界中的Na^＋／H^＋转运蛋白中是保守的。结合亲疏水资料，我们认为Na^＋／H^＋转运通道结构可能存在于这一区域。另外，也分析了RpNHX1可能的糖基化、酰基化和磷酸化位点。从这些数据中可以看出，RpNHX1可能在细胞中起到Na^＋区隔化作用。