牡丹SCoT分子标记正交优化及引物筛选

编号 zgly0000741788

文献类型 期刊论文

文献题名 牡丹SCoT分子标记正交优化及引物筛选

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 侯小改  王娟  贾甜  张钰乾  侯娟  李嘉珏 

作者单位 河南科技大学农学院  河南科技大学林学院 

母体文献 华北农学报 

年卷期 2011,26(5)

页码 92-96

年份 2011 

分类号 S567.03 

关键词 牡丹  SCoT-PCR  反应体系  正交设计  引物筛选 

文摘内容 以牡丹基因组DNA为模板, 采用L16(45)正交试验设计对影响目标起始密码子多态性一聚合酶链式反应(SCoT-PCR)的五因素(Taq酶用量、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和引物浓度)进行优化试验, 建立了优化的牡丹SCoT-PCR反应体系: Mg2+2.50mmol/L、dNTPs0.25mmol/L、引物0.60μmol/L、TaqDNA聚合酶0.50U、模板DNA1.00ng/lμL, 1×PCR-Buffer, 总体积20.00μL。比较各因素对扩增反应的结果, 其中以Mg2+浓度的影响最大, DNA模板用量的影响最小。运用牡丹17个品种验证了该体系稳定可靠, 并从36个SCoT引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的24个引物。这一体系的建立及多态性引物的筛选为今后利用SCoT标记技术对牡丹进行相关研究提供了科学依据。