基于流式细胞术和K-mer方法测定6种槭属植物基因组大小

编号 zgly0001749519

文献类型 期刊论文

文献题名 基于流式细胞术和K-mer方法测定6种槭属植物基因组大小

作者 马秋月  王玉虓  李倩中  李淑顺  闻婧  朱璐  颜坤元  杜一鸣  解志军  李淑娴  欧阳芳群  鲁成代 

作者单位 江苏省农业科学院休闲农业研究所  南京林业大学林学院  襄阳市林业科学技术推广站  北京市植物园  天水市五小叶植物保护研究所 

母体文献 南京林业大学学报:自然科学版 

年卷期 2023,47(1)

页码 163-170

年份 2023 

分类号 S687.9  S722 

关键词 槭属  基因组大小  流式细胞术  K-mer分析 

文摘内容 【目的】槭属植物种类繁多,具有观赏、油用、药用等重要价值,开发应用前景广阔。基于流式细胞术和K-mer分析方法,首次进行6种槭树基因组大小测定,为槭属植物分子生物学、细胞学研究提供重要理论参考。【方法】以6种槭树嫩叶为材料,WPB为细胞核解离液,大豆(Glycine max‘Polanka’)和玉米(Zea maysCE-777)为内标,利用流式细胞检测技术和K-mer分析法估测6种槭树的基因组大小。【结果】基于流式细胞术测定建始槭(Acer henryi)、三角枫(A.buergerianum)、秀丽槭(A.elegantulum)、血皮槭(A.griseum)、五小叶槭(A.pentaphyllum)和青楷槭(A.tegmentosum)的基因组大小分别为(691.12±8.69)、(863.90±8.69)、(896.50±4.35)、(893.24±8.69)、(766.10±8.69)和(1 154.04±13.04) Mb;以K-mer分析法估测的基因组大小分别为561.72、743.00、777.87、771.51、650.64和1 103.46 Mb;杂合率分别为1.00%、1.24%、1.31%、1.08%、0.28%、0.81%。K-mer分析法估测的基因组大小略小于流式细胞术预测结果。【结论】本研究的结果可丰富槭属植物基因信息库,也可为该属植物基因组学、分子细胞遗传学等研究奠定重要基础。