葡萄中4个花发育相关MADS-box基因的表达与生物信息分析

编号 zgly0001652447

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄中4个花发育相关MADS-box基因的表达与生物信息分析

作者 赵伟  罗尧幸  焦晓博  韩凯  刘榕晨  李雪雪  高美英  纪薇 

作者单位 山西农业大学园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年20期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S663.1 

关键词 葡萄  花发育  MADS-box基因  转录组  生物信息分析 

文摘内容 MADS-box转录因子是调节植物开花的一类重要的转录调控因子。为了研究葡萄花发育相关MADS-box基因在花器官生长发育过程中的表达特征,本试验以‘北醇’葡萄两性花生长发育过程中三个时期的花器官为试材,对其进行转录组测序分析后筛选出4个注释为花发育相关功能且表达水平较高的MADS-box基因家族成员,进行生物信息分析。结果表明,4个MADS-box基因均含有内含子和外显子结构,各基因CDS区域均较为分散,呈现断裂基因特征;对各基因进行启动子顺式作用元件分析,均包含多类花发育相关的功能元件;基于转录组结果数据,4个葡萄MADS-box基因在花器官发育的三个时期均有表达,VIT14s0083g01050与VIT10s0003g02070的表达量呈逐渐下降的趋势,而VIT18s0001g01760与VIT15s-0048g01270的表达量先上升后下降,且VIT18s0001g01760在S1时期的表达水平显著高于其它基因;分析4个基因基本信息及其蛋白理化性质发现,各基因结构极为相似;多物种系统进化树表明,VIT18s0001g017-60与黄瓜中已知花发育相关基因CUM26同源性最高,初步推测其可能与葡萄花发育过程具有较高相关性。本研究为MADS-box基因功能研究提供了理论依据。