苋菜WRKY13基因克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001639779

文献类型 期刊论文

文献题名 苋菜WRKY13基因克隆与生物信息学分析

作者 赵梅  赵芳  彭丽云  潘君飞  张梓浩  赖钟雄  刘生财 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S636.4 

关键词 苋菜  WRKY13  ORF  克隆  生物信息学 

文摘内容 以苋菜试管苗为材料,利用实验室构建的苋菜转录组数据库,筛选出WRKY13基因cDNA序列,对其开放阅读框(ORF)进行克隆验证和生物信息学分析。结果表明,WRKY13基因ORF长度为675 bp,编码224个氨基酸。通过生物信息学预测,该蛋白属于疏水性蛋白,有44个氨基酸位点存在磷酸化修饰;是WRKY蛋白超级家族(WRKY superfamily)的一个成员,存在1个WRKY结合位点;其二级结构由无规则卷曲结构、β折叠组成和α螺旋;蛋白系统进化树分析表明苋菜WRKY13蛋白独立形成一个分支,但与拟南芥、芜菁、烟草、葡萄聚类到一起,说明WRKY13蛋白在生物进化过程中还是比较保守的。本研究获得了苋菜WRKY13基因完整ORF,这为将来深入研究苋菜WRKY13基因功能提供了科学依据,也为研究其调控甜菜红素代谢过程的影响提供参考。