基于重测序技术的马尾松与火炬松基因组比较分析

编号 zgly0001731536

文献类型 期刊论文

文献题名 基于重测序技术的马尾松与火炬松基因组比较分析

作者 贾婕  冯源恒  杨章旗 

作者单位 广西壮族自治区林业科学研究院国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心广西马尾松工程技术研究中心 

母体文献 广西林业科学 

年卷期 2020,49(4)

页码 547-549

年份 2020 

分类号 S791.24 

关键词 重测序  基因组  马尾松  火炬松 

文摘内容 通过基因组重测序技术,比较马尾松(Pinus massoniana)与火炬松(P.taeda)的基因组,分析探讨以火炬松基因组为马尾松分子研究分析参考基因组的可行性。通过测序共得到231.27 Gbp的Clean Data,Q30达到87.61%,测序深度为8倍。拼接得到的马尾松reads数目有771625883个,GC含量38.14%。将马尾松重测序结果与火炬松Ptaeda 2.0基因组比较,发现有96.98%的reads可定位在参考基因组上,60.98%的reads双端测序序列均可定位到参考基因组上且距离符合测序片段的长度分布。马尾松reads对火炬松参考基因组的覆盖度为62.59%。马尾松基因组与火炬松基因组匹配率高,可以用火炬松基因组为马尾松分子研究提供参考。