燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构

编号 zgly0000803480

文献类型 期刊论文

文献题名 燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘华波  王哲  刘君  麻丽颖  王斯琪  唐岩  庞晓明 

作者单位 北京林业大学计算生物学中心北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2012(8)

页码 68-74

年份 2012 

分类号 S718.46 S718.54 

关键词 西伯利亚杏  微卫星  遗传多样性  群体遗传结构 

文摘内容 以西伯利亚杏分布的核心区域燕山山脉地区的17个群体为材料,利用9对微卫星标记进行遗传多样性和遗传结构的分析。在533个个体扩增得到203个等位基因,每位点平均等位基因数为22.556个。分析表明燕山山脉西伯利亚杏群体具有较高的遗传多样性,每位点平均有效等位基因数(Ne)为5.714,多态位点百分率(P)为100%,期望杂合度(He)为0.788。根据有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)和Shannon信息指数(I)3个遗传多样性参数,遗传多样性最高的群体为北京八达岭,其次为平泉榆树林子,而最低的群体为崇礼驿马图。群体间总的遗传分化系数FST为0.065,总的基因流Nm为3.836。分子方差分析(AMOVA)结果显示燕山山脉地区西伯利亚杏群体的遗传变异主要存在于群体内(95.62%)。Mantel检验发现遗传距离与地理距离呈显著相关性(r=0.5894,P〈0.0001)。UPGMA聚类结果显示,地理距离接近的群体聚在一起,进一步验证了Mantel检验结果。基于上述分析结果,提出西伯利亚杏的种质收集策略。研究结果为西伯利亚杏可持续利用与保护提供一定的理论依据。