利用SAGE方法分析家蚕基因表达数目的初探

编号 zgly0001299081

文献类型 期刊论文

文献题名 利用SAGE方法分析家蚕基因表达数目的初探

作者 黄健华  王四宝  苗雪霞  黄勇平 

作者单位 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所  中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所 上海200032  上海200032 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2005年04期

年份 2005 

分类号 S881.2 

关键词 家蚕  基因表达序列分析  标签  基因转录本 

文摘内容 SAGE(serial analysis of gene expression)是基因表达水平差异分析和大规模发现新基因的分子生物学技术。已构建了家蚕卵、幼虫、蛹、成虫等4个不同发育时期的SAGE表达库,经测序分别得到69 100、62 232、63 966和62 666个基因标签序列,其中特异标签数目依次为17 718、13 243、14 044和15 224。这些特异标签数目即为家蚕在这4个不同发育时期的基因转录本数量。根据测序数与获得标签的数量动态监测,发现测序的数目尚未达到饱和,因此基因转录本的数目还可能会有所增加。在上述研究的基础上,利用SAGE数据为基础,采用双倒数作图求最大值的方法,推测出了家蚕在4个不同发育时期的基因表达数目,同时也发现家蚕卵期的基因表达数目远远大于其它3个时期。