杜鹃花EST-SSR标记的开发及遗传多样性分析

编号 zgly0001530924

文献类型 期刊论文

文献题名 杜鹃花EST-SSR标记的开发及遗传多样性分析

作者 李美芹  潘叶羽  钱萍仙  卢丹  明萌  饶慧云  刘蓉  谢晓鸿  吴月燕 

作者单位 上海海洋大学水产与生命学院  浙江万里学院生物与环境学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S685.21 

关键词 杜鹃花  EST-SSR  PAGE  遗传多样性 

文摘内容 从NCBI公共数据库下载2 535条杜鹃花相关表达序列标签(expressed sequence tags,EST),SSR位点搜索共得到435个位点。利用Primer5.0对重复基元数较大的30个SSR位点设计引物,通过混合基因池进行引物初筛,25对引物可扩增出条带;利用非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究25对SSR引物的PCR扩增特点。14个SSR位点为多态性,各位点的等位基因介于2~5个,平均等位基因数3.8个;观望杂合度Ho、期望杂合度He、多态信息含量PIC范围分别为0~0.8333、0.0816~0.7172、0.0767~0.6471;多态位点中有5个高度多态、7个中度多态和2个低度多态。非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果表明:开发的14个EST-SSR标记能有效鉴定种质资源,对于杜鹃花品种的鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。