桦剥管菌SRAP分子标记反应体系优化与遗传多样性分析

编号 zgly0001574014

文献类型 期刊论文

文献题名 桦剥管菌SRAP分子标记反应体系优化与遗传多样性分析

作者 彭木  王秋玉  闫绍鹏 

作者单位 东北林业大学生命科学学院 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 S718.8 

关键词 桦剥管菌  SRAP  反应体系优化  遗传多样性 

文摘内容 桦剥管菌Piptoporus betulinus作为一种褐腐真菌,是白桦木材的专性腐朽菌,在工业污染物降解和医药领域中起着重要作用。以桦剥管菌为材料,在SRAP-PCR体系优化的基础上,对来自东北主要林区（带岭、塔河、帽儿山以及敦化）不同种群的桦剥管菌进行遗传多样性分析,为桦剥管菌多态性鉴定以及进一步利用提供理论依据。结果表明:用单因素法及均匀设计法优化后的SRAP-PCR体系为10×Buffer 2.0μL、Primer各8μmol/L、dNTP 16 mmol/L、Taq polymerase 2.5 U、DNA 12 ng、Mg2+45 mmol/L,总体积20μL;利用优化的反应体系筛选出15对引物,并扩增出239条清晰的条带,其中237条为多态性条带,多态性比率为99.16%;采用POPGENE软件分析,4个种群的平均有效等位基因平均数、平均Nei’s多样性指数、平均Shannon多样性指数分别为1.499 5、0.303 0、0.465 5;系统聚类结果显示,15个菌株分成了两个类群,这一结果表明来自同一地点菌株的遗传背景较为相似,揭示了桦剥管菌菌株间遗传特性与地理分布间的相互关系。