基于线粒体COI和16S片段序列的北部湾北部水螅水母DNA条形码分析

编号 zgly0001630431

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体COI和16S片段序列的北部湾北部水螅水母DNA条形码分析

作者 张珰妮  郑连明  何劲儒  张文静  林元烧  李阳 

作者单位 厦门大学海洋与地球学院  厦门大学海洋生物多样性与全球变化研究中心  福建省海陆界面生态环境重点实验室 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 Q953 

关键词 DNA条形码  分子标记  矢量分析  物种鉴定  水螅水母 

文摘内容 水螅水母类是浮游动物群落的重要组成部分,在近岸海洋生态系统物质循环和能量流动中扮演着重要角色。水螅水母类形态结构简单,但其物种的准确鉴定一直是分类工作中的难点。DNA条形码极大地促进了水螅水母物种的快速、准确鉴定。本研究扩增了北部湾北部28种水螅水母的线粒体COI和16S序列,分别为92条和116条;比较了2个基因片段的种内、种间K2P(Kimura 2-parameter)遗传距离;构建了基于这2个基因片段的系统发育邻接树(neighbor-joining phylogenetic tree);并结合矢量分析构建了Klee-diagram图。结果显示:COI序列的种内遗传距离为0.008±0.005(0–0.033),种间遗传距离为0.298±0.128(0.092–0.597);16S序列的种内遗传距离为0.006±0.010(0–0.047),种间遗传距离为0.394±0.195(0.068–0.898)。2个基因序列在所调查种类中,种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在明显的条形码间隔(barcoding gap)。基于2个基因片段的NJ树均显示,单种所有个体都位于同一独立分枝。研究结果表明,以COI和16S作为DNA条形码均能对北部湾北部常见水螅水母类进行物种鉴定。