茶树TCP转录因子的鉴定与表达分析

编号 zgly0001689395

文献类型 期刊论文

文献题名 茶树TCP转录因子的鉴定与表达分析

作者 温贝贝  罗勇  刘冬敏  张向娜  李娟  王英姿  王坤波  黄建安 

作者单位 湖南农业大学茶学教育部重点实验室  国家植物功能成分利用工程技术研究中心  湖南省植物功能成分利用协同创新中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年12期

年份 2019 

分类号 S571.1 

关键词 茶树  TCP转录因子  全基因组  系统进化分析  定量表达 

文摘内容 基于茶树基因组数据,通过生物信息学方法,对茶树全基因组TCP家族成员进行染色体定位、基因结构、编码蛋白特性和系统进化关系分析,同时采用荧光定量PCR验证茶树TCPs在不同组织部位的相对表达水平。结果表明,茶树全基因组中共鉴定出36个具有典型TCP保守结构域的转录因子基因,其CDS全长和编码氨基酸的数量分别在453～1 824 bp和150～607 aa之间,命名为CsTCP1～CsTCP30。系统进化分析显示,茶树TCP转录因子家族可分为2个亚族:ClassⅠ和ClassⅡ,并可进一步分为8个亚组（A～H）,其中ClassⅠ亚族中的TCP蛋白属于PCF或TCP-P类型,而ClassⅡ可分为CYC/TB1和CIN两种类型。基因结构和保守结构域分析结果显示,同一亚组内,TCP蛋白具有相似的氨基酸结构和保守区域,而不同亚组之间具有较大差异,暗示不同类型TCP转录因子可能具有独特的生理功能。除CsTCP21b外,其余35个CsTCP基因在茶树叶片不同生长时期均有表达,但其表达水平呈现不同趋势;荧光定量分析显示其家族成员具有组织表达特异性;外源GA3和ABA处理可以显著激活或抑制该家族基因成员的表达。