油茶CLE基因家族的鉴定

编号zgly0001750544

文献题名油茶CLE基因家族的鉴定

责任者 赵松子

著者单位 江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室

年卷期2023,51(1)

年份2023

母体文献南方林业科学

分类号 S794.4 Q78

主题词 油茶 CLE 产量 CLAVATA3 小分泌蛋白

页码7-11

文摘内容 CLE基因家族编码小分泌蛋白,参与调节植物的生长与发育;CLAVATA3(CLV3)是该家族中与作物产量相关的基因,其序列短、相似度低,鉴定该基因比较困难。本研究利用生物信息学的方法对油茶(Camellia oleifera)基因组数据进行了分析,从注释的蛋白质数据中鉴别出11个油茶CLE基因;开发了一套从基因组序列中预测CLV3基因的方法,鉴别出1个油茶CLV3基因;基因表达分析表明,CoCLV3在种仁、柱头、叶等部位的表达水平较高;利用CLE基因家族蛋白质序列的CLE基序进行比对分析并构建进化树,结果表明,CoCLV3是AtCLV3的同源基因。

油茶CLE基因家族的鉴定

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