昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析

编号 zgly0001466258

文献类型 期刊论文

文献题名 昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析

作者 张梅  周晓穗  陈佳林  梁士可  李广宏  王方海 

作者单位 中山大学生命科学学院昆虫学研究所/有害生物控制与资源利用国家重点实验室 

母体文献 环境昆虫学报 

年卷期 2014年05期

年份 2014 

分类号 Q963 

关键词 保幼激素酯酶  DNA甲基化  基因结构  CpG O/E值  外显子 

文摘内容 本研究选择西方蜜蜂Apis mellifera、黑腹果蝇Drosophila melanogaster、致倦库蚊Culex quinquefasciatus和家蚕Bombyx mori 4种昆虫为例,以降解保幼激素的特异性酯酶(juvenile hormone esterase,JHE)为研究对象,首先运用NCBI的Spidey在线软件将各昆虫的JHE基因与其相应的基因组序列作比对,分别确定各昆虫JHE基因的上游2000 bp的具体序列和外显子及内含子区域。发现西方蜜蜂JHE基因含有7个外显子和6个内含子,而其余三种昆虫的JHE基因均含有6个外显子和5个内含子。接着,分别统计基因各区域的CpG,G,C位点的占有量,并计算出CpG O/E值(CpG位点的实际值与期望值之间的比值),发现各区域CpG O/E平均值的大小依次为:基因上游2000 bp区>内含子区>外显子区,基因上游2000 bp区的CpG O/E平均值大于1.0,而第1到第4外显子的CpG O/E平均值均只有0.8左右。表明在昆虫JHE基因中,若有CpG甲基化位点发生,应主要发生在第1到第4外显子区域。